En diciembre del año 2000 se celebra el Tercer Cabildo de Elecciones en el que sale elegido Jesús María Martagón Sánchez.
El año 2002 será de gran importancia para la Hermandad, pues se conmemora el CCCXXV Aniversario fundacional. Para celebrar tan importante efeméride se programan una serie de actos y cultos extraordinarios, entre los que se incluyen la salida extraordinaria en Vía Crucis de Nuestro Padre Jesús Nazareno el sábado 23 de febrero hacia la Parroquia para celebrar el octavo día de novena en su honor y posterior vuelta hacia el Convento, salida extraordinaria en Rosario de la Aurora de la Virgen de las Lágrimas el 6 de octubre (celebrándose desde entonces este culto externo), y terminando todos ellos con la salida extraordinaria en su paso procesional de Nuestro Padre Jesús Nazareno el sábado 9 de noviembre. En el transcurso de esta salida extraordinaria se le impuso a la Venerada Imagen de Jesús Nazareno la Medalla de Oro de la Villa de La Puebla de Cazalla, distinción otorgada por el pleno del Ayuntamiento de la Localidad.
La jornada comenzó a las cinco de la mañana con el canto de los Pregones de Jesús en el Templo del Convento y ante la Imagen de Jesús ya dispuesto en su paso procesional. A las seis daba comienzo la procesión extraordinaria que llevaría al Señor hasta el Templo Parroquial de la localidad, desde donde saldría nuevamente en procesión a las seis de la tarde, dirigiéndose primero al Ayuntamiento para recibir la Medalla de la Localidad y una vez impuesta, posesionar por distintas calles de la localidad hasta bien entrada la madrugada del domingo 10 de noviembre.
Este mismo año la localidad conmemora el Quinientos aniversario de la Carta Puebla y por tal motivo se celebra un Santo Entierro Magno el Sábado Santo 30 de Marzo por lo que Nuestro Padre Jesús Nazareno sale en salida extraordinaria junto con el resto de las Hermandades de la localidad para formar parte del cortejo procesional de este Santo Entierro Grande.
En la mañana del 9 de febrero de 2003, primer domingo de cuaresma y segundo día de novena a Jesús Nazareno se celebro el I Pregón de la Juventud, siendo organizado por el Grupo Joven de la Hermandad y estando a cargo de Don Manuel Martín Alcazar (Secretario 2º de la Hermandad por aquel entonces). Este acto se ha mantenido hasta nuestras fechas, contando cada año distintos hermanos que han contado sus vivencias y transmitidos sus sentimientos hacia su Hermandad.
En enero de 2005 se celebra el Cuarto Cabildo de Elecciones en el que resulto elegido Francisco José Guerrero Bonilla, transcurriendo su mandato hasta el 1 de noviembre de 2009, día en el que se celebra el Quinto Cabildo de Elecciones, presentándose por primera vez dos candidatos a Hermano Mayor, resultando elegido Manuel Martagón Montesinos, quien junto con su Junta de Gobierno dirigirá la vida de esta Hermandad durante los próximos cuatro años.
El viernes 19 de febrero de 2010, primer viernes de cuaresma, se celebra un Vía Crucis presidido por la Imagen de Jesús Nazareno, recorriendo barrios y calles por las que habitualmente no procesiona. Este acto se mantiene durante cada año como acto previo al inicio de la Novena en honor a Ntro. Padre Jesús Nazareno.
Un lamentable y desafortunado hecho tiene lugar la tarde noche del viernes 23 de julio de este mismo año de 2010. La túnica de Jesús Nazareno sale ardiendo como consecuencia de una vela que alguien coloca debajo de la misma. La rápida actuación de varios hermanos impidió que las llamas afectaran de manera mas grave a la Venerada Imagen. Al día siguiente, en Sesión Extraordinaria, la Junta de Gobierno acuerda ponerse en contacto con el restaurador Juan Alberto Pérez Rojas, para que haga una primera valoración de los daños sufridos en la Imagen de Jesús Nazareno, así como indique las actuaciones de reparación que se deben realizar sobre la misma. Ese mismo día el restaurador local, Justo Guerrero, examina la Imagen para valorar el alcance de los daños sufridos y aconsejar medidas de actuación con respecto a la restauración del Señor. El lunes 26, las Imágenes vuelven a exponerse al culto, aunque con la reja de la Capilla cerrada para impedir que los fieles puedan tocar al Señor. El viernes 30 se celebra una misa como Acto de Homenaje a Jesús Nazareno, siendo la mañana del lunes 02 de agosto cuando definitivamente se retira del culto la Imagen de Jesús Nazareno siendo trasladada a Sevilla, al taller del anteriormente mencionado restaurador para proceder a su restauración. Dicho proceso de restauración tiene una duración de cinco meses, siendo repuesto al culto el día 31 de Diciembre de 2010 con la celebración de la Solemne Jornada de Oración y Solemne Eucaristía de Acción de Gracias a cargo del Señor Vicario de la Zona Sur, D. Jose Joaquín Rebolo Vázquez. Desde Agosto de 2010 se viene celebrando todos los viernes en la capilla el rezo del Santo Rosario.
El 26 de Mayo del 2013 se celebra nuevo Cabildo Oficial de elecciones, resultando elegido Juan Miguel Correa Vazquez como Hermano Mayor.